全血基因組DNA小量提取試劑盒
Total Blood DNA Miniprep
Kit
● 試劑盒內容及保存:
試劑盒組成
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RTG2406
(50次)
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貯存方式
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緩沖液DL1
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16
ml
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常溫
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緩沖液DL2
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16
ml
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常溫
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去蛋白液GD(濃縮液)
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18 ml
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常溫
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漂洗液PW(濃縮液)
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25
ml
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常溫
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洗脫緩沖液EB
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15
ml
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常溫
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吸附柱CG
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50個
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常溫
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收集管(2
ml)
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50個
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常溫
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說明書
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1份
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● 儲存條件和效期:
該試劑盒常溫貯存,常溫運輸。開封后有效期一年。
● 產品簡介:
全血基因組DNA
小量提取試劑盒可從200-400 μl體積新鮮、冷凍或抗凝全血樣本中快速分離純化基因組DNA。該試劑盒可以在30分鐘內完成單個或多個樣品的操作。 提取過程無需使用蛋白酶K消化,不需要酚氯仿抽提,
也無需耗時的異丙醇沉淀等過程 。
使用該試劑盒提取到的DNA
可以用于PCR,Southern雜交,酶切消化等實驗。
● 準備工作:
1. 準備無水乙醇;1.5
ml離心管;離心機
2. 按照標簽所示在去蛋白液GD和漂洗液PW中加入無水乙醇,混勻后蓋緊瓶蓋后常溫貯存備用。
3. 每次使用前請檢查緩沖液DL1和DL2是否有沉淀生成,如果出現沉淀,37℃溫浴至沉淀溶解后再使用。
● 標準操作步驟:
如非指出,所有離心步驟均為使用臺式離心機在常溫下離心。
注意:以下方案適用于400
μl體積新鮮或冷凍血液樣本。如果使用低于400 μl的全血樣本,必須按比例減少緩沖液DL1和DL2的用量或者用1×PBS溶液補齊至400 μl,嚴格按照緩沖液DL1:全血:緩沖液DL2=3:4:3體積比進行操作,否則將導致后續操作無法進行。
1. 加入300μl緩沖液DL1于1.5
ml離心管中。
2. 加入400
μl抗凝全血,漩渦劇烈震蕩30秒。 注:如果低于400 μl血液,用1×PBS補齊到400
μl。
3. 加入300μl緩沖液DL2,劇烈搖動離心管3-5次,漩渦劇烈震蕩30秒-60秒。
注:加入緩沖液DL2后,會出現大量血紅蛋白沉淀,必須劇烈震蕩。
4. 12000 rpm 離心2分鐘。
5. 把吸附柱裝在2ml收集管中,將第4步得到的上清溶液(一般可吸取650-700 μl)全部轉入吸附柱中(小心別觸及沉淀),12000 rpm離心2
min,倒棄流出液重新套上收集管。
注:吸附柱的最大體積為850 μl,如上清超過此體積,可分2次離心,保證所有上清都加到柱中。
6.加入500 μl
去蛋白液GB(注意是否已經加入乙醇)至柱子中,12000 rpm離心1min,棄流出液。
7. 將吸附柱重新套回2
ml收集管中,加入700μl 漂洗液PW(注意是否已經加入乙醇)至柱子中,12000 rpm離心1min,倒棄流出液;
8. 再加入500 μl
漂洗液PW(注意是否已經加入乙醇)至吸附柱中,12000
rpm離心1min, 棄流出液。
注:吸附柱膜上如有血色素殘余,這是正,F象,不會影響DNA的洗脫和純度。
9. 將吸附柱重新套回2
ml收集管中,12000 rpm空甩離心2 min以干燥柱子的基質;
注:這一步驟至關重要,不要省略,否則殘余乙醇會影響后續酶切或PCR實驗。
10. 將柱子置于1.5ml滅菌離心管,向吸附柱O型墊圈中央懸空加入50-100 μl65℃預熱的洗脫緩沖液EB或滅菌去離子水,蓋好吸附柱管蓋,常溫靜置2 min;
注: = 1 \* GB3 ① 洗脫緩沖液體積最好不少于50 μl,體積過小影響回收效率。
=
2 \* GB3 ② 洗脫液的pH值對于洗脫效率有很大影響。若用水做洗脫液應保證其pH值在7.0-8.5范圍內,pH值低于7.0會降低洗脫效率。
11. 12000 rpm離心
2 min洗脫DNA。保留含DNA的流出液。將DNA儲于-20℃。
● DNA濃度及純度檢測:
基因組DNA片段的大小與樣品保存時間、操作過程中的剪切力等因素有關。提取的DNA片段可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計檢測濃度與純度?膳渲0.8-1.0%瓊脂糖凝膠,使用λ/HindIII判斷基因組的大小,完整的基因組大小應在23kb以上。使用分光光度計檢測時, OD260/OD280比值應為1.7–1.9之間,如果洗脫時不使用洗脫緩沖液,而使用去離子水洗脫,比值可能偏低,但并不表明DNA純度不高。
● 常見問題分析:
常見問題
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可能原因
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建議
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堵柱子
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樣本體積不對,裂解不完全
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未按照說明書使用指定體積操作,請嚴格按照緩沖液DL1:全血:緩沖液DL2=3:4:3體積比進行操作
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回收不到DNA或得率低
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堵柱子
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見上
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化療病人全血中提取DNA
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化療病人血液中白細胞數量減少,導致DNA數量降低
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全血樣品保存不當,導致全血溶血導致DNA降解
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4℃冰箱中貯存2周的全血開始出現溶血現象,此時DNA隨貯存時間延長會程序分解,最終導致分離不到電泳可見的DNA;全血應該-20℃或-80℃貯存。
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去蛋白液GD和漂洗液PW沒有按說明書加入乙醇稀釋
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使用前按說明書加入適量的無水乙醇進行稀釋
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DNA純度差
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高A260/A280比率大于1.8
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考慮全血樣品的新鮮程度。陳舊全血中的DNA會降解成小片段DNA或核苷酸混合物,導致A260讀數變大
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DNA中有RNA污染
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使用非常新鮮的全血提取DNA時電泳結果會有RNA污染,RNA不能作為擴增模板,不會影響PCR擴增。如要去除RNA,可在步驟1加入緩沖液DL1時同步加入5 μl RNaseA溶液(10mg/ml)
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洗滌時柱中有帶顏色的遺留物
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未按照說明書使用指定體積操作
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請嚴格按照緩沖液DL1:全血:緩沖液DL2=3:4:3體積比進行操作
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去蛋白液GB和漂洗液PW沒有按說明書加入乙醇稀釋
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使用前按標簽加入標示體積的無水乙醇進行稀釋
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實驗示例:
400μl human blood gDNA 上樣5μl
人血液基因組擴增人β-球蛋白 1.3kb 片段